Periodo de 1840-1876

Este periodo fue el de mayor inquietud y de temor que causó las oligarquías regionales, este fue el periodo donde la política de privatización de los recursos naturales y de la desamortización de sus bienes, hicieron que el indígena perdiera su autonomía.

Esto originó una ola de generalización de rebeliones indígenas y campesinas por todo el país, a las que se le llamó "guerra de castas".

Este tipo de violencia provocó en varias ocaciones y en diferentes regiones, los grupos oligárquicos llegaron a buscar soluciones como la aniquilación o exterminio de las etnias indígenas